2000年9月28日，以色列政客沙龙前往耶路撒冷东区并登上圣殿山，象征对被占领土拥有主权，而伊斯兰宗教圣地阿克萨清真寺就位于圣殿山上。此举被巴勒斯坦人看作是一种挑衅，哈马斯呼吁袭击以色列军事据点，第二次巴勒斯坦起义开始了。
哈马斯对以色列平民使用了自杀性袭击手段，数月后沙龙当上总理，对哈马斯展开了疯狂报复。在以色列实施的“定点清除” 中，哈马斯遭受重创，2004年，哈马斯创始人及精神领袖亚辛被暗杀。同年，亚辛的政治接班人兰提西也遭刺杀。
在亚辛和兰提西被暗杀后，流亡海外的迈沙阿勒成为哈马斯最高领导人。1956年，迈沙阿勒出生于约旦河西岸城市拉姆安拉，第三次中东战争后被迫随父母离开家园，从此一直流亡海外，对以色列充满仇恨。上世纪90年代初，他在流亡约旦期间，成为哈马斯高级领导人，多次遭到以色列人暗杀。1997年9月，以色列两名特工给他注射了毒药，在生命垂危之际，约旦警方抓获了这两名特工，用他们与以色列交换了解药，救了迈沙阿勒一命。随后，约旦以威胁国家安全和稳定为由将他驱逐出境，迈沙阿勒流亡至叙利亚继续战斗。
