朱允炆听到祖父给自己留有一个保命的宝匣，喜从悲来，赶紧让王钺带自己去拿这个宝匣。
众人来到奉先殿后，找到并打开了这个红色宝匣，只见宝匣里面放着三张度牒(相当于僧尼的身份证)，度牒上写有"应文"、"应能"、"应贤"，还有袈裟、僧帽、僧鞋、剃刀，以及银元宝十锭。除此，写有"应文"2字的度牒的后面写着："应文从鬼门出，其余人等从水关御沟而行，薄暮时分在神乐观的西房会合"，显然这是朱元璋为朱允炆安排的逃跑路线。
看到这些东西后，程济立即为朱允炆剃发，换上袈裟、僧帽、僧鞋。
吴王教授杨应能以自己名"能"为由，表示愿意剃度，以"应能"为法号，随帝流亡;监察御史叶希贤也说自己名字中带有"贤"，表示自己就是"应贤"，也愿意剃度随从。
除此，当时在建文身边的五六十位近臣也表示愿意跟随他流亡天下。
之后，朱允炆认为这么多人一起行动，一定会引起朱棣的怀疑，在与近臣商量后，决定由九个人陪着朱允炆前往鬼门，在神乐观乘船至太平门。
杨应能、叶希贤等十三人从水关御沟而行，在神乐观的西房会合。
流亡前，为免途中引起别人的注意，只留杨应能、叶希贤、程济三人贴身陪在朱允炆左右，杨应能、叶希贤为僧人，程济为道人，其余人则遥为应援。
除此，朱允炆特意交代他们互相以师弟称呼，不必君臣相称。
朱允炆一行人的第一站来到了位于吴江县的翰林院侍书史彬家中。
八月十日，朱允炆又来到襄阳的廖平家中，没待多久，获悉追兵已经在后面，便决定前往云南。而后，朱棣得知朱允炆一行人可能逃到西南地区，便派遣户科都给事中胡濙前往西南地区，以寻访道教宗师张三丰为由，秘密侦查朱允炆的下落。
永乐八年(1410年)三月，工部尚书严震以出使安南的名义，至云南秘密寻找朱允炆。
某一日，严震在机缘巧合下找到了朱允炆，可是严震并没有捉拿朱允炆，他对朱允炆仍然有君臣之念，他不想以上犯下，更不想建文帝被下狱，失去皇帝的尊严。
