韩世忠等人前来救驾，把苗、刘抓了回来。苗傅和刘正彦拿出了"免死铁券"，结果被告知，虽"除大逆外，余皆不论"，但你俩正好是谋反，是大逆之罪，不能赦免，随后二人被凌迟。苗刘兵变虽然很短暂，最终赵构的权力也没受到威胁，但是却对赵构此后的政策和身心影响非常深刻。
赵构不仅仅因此事惊吓过度，失去了生育能力，更加意识到了武将拥有自己的嫡系部队带来的重大隐患，这也为他后来处理岳飞埋下了伏笔。南宋建立之初，赵构的帝位还不稳固，为了对抗金军，放宽了限制，允许武将招募军队，所以才有了岳家军、韩家军这样的私人武装。
身边的两个区区禁军小军官，居然都敢质疑自己的皇位合法性，并且敢带亲兵造反，逼自己退位！金人还没能夺了他的皇位，但自家的武将却随时可以做到！赵构不禁感慨，还是祖宗曾经立下的规矩好啊！重文轻武一定要坚持下去，否则武将的权力过大，对皇权是天大的威胁，这样的事情还会再次发生！
后来的岳飞，和苗刘兵变的情形非常相似，都是对皇帝和皇帝身边的人不满，并且表示要迎回二帝，而岳飞的军事力量和人气远远不是苗刘能比的，如果岳飞也来个兵谏逼宫，赵构不可能再有翻身的机会，想想都会脊背发凉。或许，这也是他想杀岳飞的一个原因。
（参考资料：《宋史》、《续资治通鉴》、《建炎以来系年要录》等）
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