当时的皇帝已经是宋太宗赵光义了，当时他为巩固自己的权利，加强对政局的控制，暗中派人查看各地方官员的动静。结果，这事让王嗣宗发现了，他不管三七二十一，直接将来宋太宗派来暗查之人抓了起来，然后更不给皇帝面子，直接将这些人接送到京城，还上书说："陛下不委任天下贤俊，猥信此辈以为耳目，臣窃不取"，这无疑是在打皇上的脸，赵光义大怒，立刻派人将王嗣宗抓了起来，押解到京，投入了大狱，并停发其俸禄。
当然，赵光义作为宋朝开创人之一，在史书上记载尽管有些小心眼，但算得上一代明君，他此举，无外乎是惩戒王嗣宗这种蛮横，不守规矩的毛病，要他明白谁是老大。所以不久，就赦免了王嗣宗，并恢复了官职。
此后的王嗣宗似乎收敛了些性格，他先以秘书丞通判澶州，因为政绩不错，被召回京，拜为三司开拆推官。可江山易改，本性难移，回京不久，因妻子病急，他夜撬衙门取药，又被罢官。
不久他又被重新起用，不过是被下放到了地方为官，但他的能力摆在这，在地方的他依旧能做出一番政绩，如在河北时，因为擒获群盗，受太宗嘉奖。后在江浙荆湖发运使时，通过破除江浙一带迷信的之风，保持了社会稳定，百姓安乐。总之，王嗣宗的官职虽一直调整，但他在每个职位上都能做出好成绩，政绩极佳。
