然而在中国医学科学院发布的中国医学院校科技量值排行榜上，北京协和医学院与清华大学（医学学科）是分开排名的。在最近的2020年的榜单里，协和高居榜首，而清华却位列第32。
2006年的《意见》要求，清华、协和合作之后，清华大学不再另办医学院。
但是清华大学面对着其他兄弟高校用20年消化了独立医学院校近百年的医学教育积淀，还承接了不少优质老牌的三甲医院。清华的临床医学教育似乎正在越掉越远。
内忧外患之下，着急的清华大学，即便有"联合办学"的约束，还是毅然决然的另起炉灶，尝试培养自己的医学学科，直到最近高调宣布将组建医学部（本部）。
综合高校的"医学院"狂热
清华大学办医的执着，也是全国综合大学打造"医学院"持续热情的一个缩影。
进入21世纪以来，综合大学对于医学学科的建设热度不减。
一位卫健系统的研究人员告诉八点健闻，在现代科学里，生物科学和医学是近些年最炙手可热的学科，建起医学院后，科研经费、科研项目、甚至高级职称会成倍增加。
以上海交通大学为例，在合并上海第二医科大学之初的2003年，上交大的国自然基金增长数仅为0.1亿元，其中医学部分所占比例仅为18%。在潜心发展融合10余年后，2017年，上交大国自然基金增长数已达到2.77亿元，相较2003年翻了27倍还要多，其中医学部分所占比例高达41%。
八点健闻统计2021年国自然基金立项数目和立项金额发现，排名前10的大学，都是曾经合并过独立医科大学的综合大学。
在2000年的大学合并潮里，许多综合大学通过合并的方式"拿下"了不少历史悠久、创办时间动辄近百年的高水平独立医学院校，同时也一并将这些医学院校的附属医院收入囊中，可谓一石二鸟。
这些综合大学用了20余年的时间，吸收了这些医学院校近百年的医学学科教育成果。而在2000年的合并潮中，没有成功牵手心仪的独立医学院校的综合大学，只能选择自建或共建医学院。
上海医学教育系统的一位资深人士告诉八点健闻，大学发展医学学科的时间维度至少要以30年为计，所以自建医学院，又想短时间内出成绩那几乎是不可能的事情。
一位医学教育专家指出，目前很多著名理工科院校办的医学院。创办的医学院，目前看来都不算成功，"在培养医生方面，如果人们没有感受到你的医生很强大的时候，你的医学院是立不住的。"
四川大学华西厦门医院党委书记廖志林向八点健闻表示，临床医学是"手艺活"，几乎没有天才的医生，"名医"们都是在一个又一个病例中锤炼而来，需要反复训练。而在这个过程中，"师傅带徒弟"这种传统模式起到非常重要的作用。而优秀的医学院之所以优秀，就是因为汇集了一群"大师"。
多名医学教育专家强调，由学生变成医生，再由医生变为大师，大师再回过头来反哺医学教育，需要循环传承才能最终成就一个成功的医学院。
