眼见抗金将领军力日益强大,秦桧恐威胁到主和派,便想法削其军权;赵构也遵其祖训"虚外防内",便听从秦桧意见,来个"第二次杯酒释兵权"。三大将同时被解兵权,金人再次以军事威胁,通知赵构,如议和要以淮水以北归金,并致书秦桧必杀岳飞和议始可成。秦桧便以"莫须有"罪名逮捕岳飞父子入狱。
赵构和秦桧同意了金人提的和议条件:"划淮为界,岁币银绢各二十五万,割唐、邓二州",史称"绍兴和议"。
和约签订后,秦桧按照金人意图罗织罪名杀了岳飞父子。天下冤之,闻者流涕。杀岳飞是赵构批准的,他是主犯,秦桧是策划者,他派其死党罗织罪名,秦桧实是直接杀岳飞的最可恶的刽子手。杀了民族英雄岳飞,秦桧的恶名更昭著,他的汉奸罪名也就永远抹不掉。
秦桧两任宰相,时间长达十九年,他以金人自重,挟制赵构,甘心为金人当走狗,一心倡议和向金人屈辱称臣。为了达到其议和的罪恶目的,凡反对议和的忠臣良将,都被他杀戮或贬谪,而附和议和的无耻之徒,则被提拔以为己用。