加盟门店对百果园的贡献十分可观。招股书显示，2019年至2021年，百果园的收入分别为89.76亿元、88.53亿元、102.89亿元。其中，2021年百果园营收有81亿元是由加盟店贡献，相当于近8成营收。
但加盟模式在扩张同时，也给百果园带来伤害。5月8日，上海市消保委点名百果园，称品牌不能一味追求扩张速度，而疏于对加盟店的管理和监督。
事实上，百果园的水果生意并不好做。2021年，百果园营收首次突破百亿，但毛利率仅11.2%，净利润则为2.26亿元。此前2019-2020年，净利润处于波动之中，分别为2.48亿元、0.46亿元。
"百果园的扩张能力被资本加持进化到一定水平，但核心风险依旧存在，不能小觑。"5月8日，盘古智库高级研究员江瀚向时代周报记者表示，一方面，国内生鲜水果市场几乎没有门槛，没有一家企业拥有足够的市占率；另一方面，极度高昂的成本管理难度居高不下，成本的有效控制是难以解决的核心难题。
的确，水果生意有着高损耗、短期限的特点，销售成本巨大。
2019-2021年，百果园的销售成本占总营收分别为90.2%、90.9%和88.8%，其中存货销售成本（主要为水果采购成本）分别占销售成本的96.2%、95.2%及95.3%。
此外，百果园还面临着负债率攀升、主营收入来源单一等多重风险因素。
招股书数据显示，2019-2021年，百果园净利润率分别为2.8%、0.5%和2.2%，资本负债比率分别为25.8%、36.7%、53.5%。其中，2021年的资本负债比率创三年来新高，公司解释为主要由于短期借款增加。
产品类别相对集中，也是经营风险之一。
