在军帅指挥部中设有文书、军册、卫队、勤务人员46名以及分管军需、器械、军法、军医的技术军官（注：统称典官）35人和大批下属（注：称听使）。其中，负责后勤的典官27人--掌握资财的典圣库2人，分管油盐、粮食和采购的典圣粮、典油盐、典买办各2人，分管武器、弹药、旗帜的典炮、典铅码、典红粉（注：负责火药）、典硝、典旗帜各2人，负责医疗急救的内医（注：内科）、掌医（注：外科）、功臣（注：此为官职名，专司伤病员的医药饮食，因为太平军将伤员统称为"功臣"）、拯急救、理能人（注：负责护理）各1人，负责筹集、制造攻防器械的典铁匠、典木匠、典竹匠、典绳索各1人。这些后勤部门既各司其职，又相互配合，比如救治伤员时，拯急救会先给伤员敷草药，然后送入"能人馆"（注：又名"功臣衙"），由内外科军医继续治疗，并由理能人负责护理调养，而伤病员的一切所需均由功臣提供。
除了这套军中后勤体系，太平军还有一套相对固定的后勤系统，即专门生产军需物资和日用品的诸匠营、百工衙。攻占金陵后，原设军中的诸匠营随之集中在天京，下设瓦匠营、金匠营、镌刻营、金靴营、织营、绣营等，还有相当于内河海军的水营，以及制造云梯等攻城器械的木营和负责土工爆破作业的土营。这些"军工企业 技术兵种"规模很大，如水营有船上万条，织营人数达1.4万，木营、瓦营亦有数千之众。
此后，太平天国又建立百工衙，将手工业纳入各典官管辖范围。在天京，102名典官分管9大行业，即兵器业、食品业、纺织服装业、建筑业、交通工具制造业、日用手工业、印玺器饰货币业、印制业和其他杂业。其中最重要的当属兵器业，下设典炮衙、铜炮衙、典铁衙、铅码衙、典硝衙、红粉衙、战船衙、弓箭衙、旗帜衙，专门制造各种枪、炮、刀、矛、弓箭、弹丸、火药以及战船、旗帜等军工产品。
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