除了掠夺财富之外，曾国藩最初的屠城还有一个目的，那就是实行"焦土战略"，制造无人区，断绝太平天国的百姓支持，使太平军得不到补充。
曾国藩曾在奏折中为清政府出主意，建议消灭太平天国附近的百姓；[使太平军]行无民之境，犹鱼游无水之池。居不耕之乡，犹鸟居无木之山"。事实也证明，曾国藩后来也是这么做的，从九江到南京，湘军将领彭玉麟曾经感叹说"鸡犬不闻三千里"。以此看来，整个湘军攻克的地方，人烟已经绝迹。
无数次的屠城过后，曾国藩的弟弟曾国荃曾说杀人过多，害怕报应。但曾国藩随即劝说弟弟曾国荃；
"既已带兵，自以杀贼为志，何必以多杀人为悔？既谋诛灭，断无以多杀为悔之理"
