阮大钺出任兵部侍郎，犹如一石击起千重浪，举朝为之哗然。许多官员纷纷告退。吕大器、姜日广先后辞官罢归。马士英则乘机安插心腹，填补空缺。他听从阮大钺计谋，全部起用了逆案官员，甚至对死者也给予赠恤。这样阉党势力再度得势，使得朝政更为腐败黑暗。
经过阮大钺事件的折腾，东林党元气大损，其活动渐趋沉寂。而马士英、阮大钺已紧密地勾结在一起，正策划着一场更大的阴谋。
弘光元年（公元1645年）冬，南京发生了一桩离奇的案件，即大悲案。大悲姓朱，安徽怀宁人，出家为僧。他来到南京，到处散布耸人听闻的淫言，一会儿自称是亲王，一会儿又说潞王贤明，弘光帝应当让位，弄得满城风雨，议论纷然大悲案牵扯到弘光帝朱由秘，显然是一个很敏感的政治案件。马、阮便借此案大做文章，"欲假以诛东林及素所不合者"，妄图把东林党和其他清流人士一网打尽 他们捏造了所谓十八个罗汉，五十三个参目，对照早已编制好的所谓蝗蛹录（即指东林党为"蝗"，复社为＂蛹＂）黑名单，写上史可法、高弘图、姜日广等人姓名，一起藏在大悲衣袖中，诬陷此案系东林党人指使。由于构陷过于露骨未能得逞。但其狼子之心，已昭然若揭。
马士英像历史上所有的奸佞一样，不但有强烈的权力欲，而且还有强烈的金钱欲。他通过种种卑劣手段聚敛钱财，中饱私囊。
江南地区自三国以来，经过历代劳动人民的开发，到了明代已发展成为土地肥沃、物产富庶的经济中心，成为明朝的主要赋税供给区。早在宋代，大词家柳。极口称赞江南的繁华和富庶。升平安乐、美丽如画的江南到了晚明则被马士英一伙地搜刮聚敛弄成了一座萧条凄凉的人间地狱。
