同时，方腊率领义军主力南征，相继占领了婺州、衢州等地。义军别部北上攻克宣州宁国县，进围广德军(今安徽广德)在这一段时间里，起义军先后攻下六州五十多县，包括今天的浙江省全境，江苏、安徽南部，江西东北部的广大地区。
义军攻打秀州失利后，杭州失去了屏障。不久，童贯率领宋军到了杭州城下，把杭州城围得水泄不通。义军经过一番苦战，因粮尽援绝而被迫退出杭州。杭州失守以后，义军所面临的环境更加恶劣。宋朝的军队一路追击，义军并没有去部署防御，各支队伍之间不能相互支援，力量分散严重。
宣和三年(1121),方腊带领义军退守到帮源峒一带。宋军得到消息后，立刻四处云集过来对帮源峒实施层层包围。合围数日后，宋军发起总攻，义军奋起抵抗，城中将士有七万余人被杀害。方腊及其妻邵氏、子方毫、丞相方肥等三十余人被俘，解往汴京，最终被残酷杀害了。
方腊被害后，义军各部继续转战浙东各地。童贯派郭仲荀、刘光世、姚平仲等领兵分路镇压 直到宣和四年(112)三月，宋朝才彻底平息了方腊领导的农民起义。宋军所到之处，烧杀抢掠， 无恶不作，义军和百姓大量被杀害，两浙经济也遭到严重破坏。方腊起义最终失败了，但是这次起义打下六州五十二县，威震东南地区，从根本上动摇了宋朝的统治，宋朝的军事力量在平息起义的过程中也受到沉重打击。公元1127年，北方刚刚兴起的金国突然南下，攻破了宋都汴梁，掳走宋徽宗、宋钦宗及宗室、大臣、妃嫔三千多人，北宋宣告灭亡。尽管北宋亡于金国之手，但是它的灭亡与其统治的腐朽有着很大的关系。所以，为政者应当善待百姓，只有百姓安居乐业，社会才会安定，国家才能长治久安。
