此时，塔克世的两个儿子努尔哈赤、舒尔哈齐均在明军中效力，在得知祖父、父亲遇害的消息后，便设法逃回赫图阿拉城，然后纠集百余名部众，依靠着父祖留下的十三副铠甲起兵，就此走上创建后金（清）政权的道路。努尔哈赤起兵后，不敢公然打出反抗明朝的旗号，而是将矛头指向尼堪外兰，向李成梁索要此人。
对于努尔哈赤的要求，李成梁很是愤怒，于是派将吏前去斥责他，声称若其不识时务的话，明朝将册立尼堪外兰为建州女真的首领，并派兵消灭努尔哈赤。事后，李成梁又觉得自己"误杀"觉昌安父子，毕竟于理有亏，便把二人的尸体归还了努尔哈亦，并答应他承袭都指挥使之职。
努尔哈赤虽然很愤怒，但是他敏锐的察觉到，李成梁之所以不愿舍弃尼堪外兰，无非是觉得他忠诚可靠，并能帮助他有效地对付女真各部。努尔哈赤考虑到此，便刻意讨好李成梁，发誓永做明朝的顺民，并愿意帮助李成梁对付与朝廷为敌的各部。时间一长，李成梁便觉得努尔哈赤忠心可嘉，对他的态度也大为改观。
努尔哈赤见李成梁已经信任自己，便趁机发动讨伐尼堪外兰的战事，一举攻陷图伦城，时在万历十一年（1583年）五月。努尔哈赤见李成梁没有采取行动，胆子愈发大了起来，紧接着又攻陷嘉班城，迫使尼堪外兰逃往鹅尔浑城，并得到明朝边将的庇护。努尔哈赤自知不能逞强，便暂时隐忍着没有继续用兵。
