李渊听说秦叔宝来降后，十分高兴，将其安排在了秦王李世民麾下，李世民早就听说过秦叔宝骁勇善战，于是对其礼遇有加，在武德年间，秦叔宝冲锋陷阵，屡建奇功，跟随李世民讨伐刘武周建立了大功，被李渊加封为上柱国。后来又跟随李世民平定王世充，加封翼国公，上次黄金百斤，帛七千段，后来天下初定，秦叔宝因功已经升为左武卫大将军。
在李世民麾下，秦叔宝可谓是龙入深海，虎啸山林，史书记载:"
叔宝应命，跃马负枪而进，必刺之万人之中，人马辟易，太宗以是益重之，叔宝亦以此颇自矜尚。
"由此可见，在李世民帐下，秦叔宝可谓是实现了其作为武将的价值。但是历史上却并没有记载秦叔宝有运筹帷幄之中，决胜千里之外的帅才，所以秦叔宝的特点就是勇猛，冲锋陷阵是一把好手，但是独自领兵的能力还有所欠缺。
