1599年，杨应龙起兵造反。战争初期，由于明王朝毫无准备，杨应龙占据优势，但随着明王朝把日本赶出朝鲜半岛，平播力量的增强，战争态势发生了逆转。1600年，杨应龙最后的据点海龙屯被明军攻占，杨应龙自杀，播州之役结束 。平播之役宣告了割据播州，传位29代，700余年的杨氏世袭统治彻底结束。之后，明朝把播州分为两个府，一个是遵义，一个是平越。
播州之役的胜利加强了中原政权对西南地区的控制，震慑了西南地区的其他土司，促进了贵州的教育和文化发展。
1645年，郑芝龙把22岁的郑成功引荐给隆武帝。隆武帝非常欣赏郑成功的才华，叹息说：惜无一女配卿，卿当忠吾家，勿相忘也。为了表示对郑成功的宠爱，隆武帝赐予国姓。郑成功的名字就成了朱成功，又称"国姓爷"。
也就是说历史上大名鼎鼎的民族英雄叫朱成功，而不是郑成功。只不过清朝不承认南明隆武政权，因此清朝人在记录历史时就把朱成功改为郑成功。就跟宋朝建立后，赵匡胤把郭荣称为柴荣是一样的道理。
中国古人很早就知道台湾岛，但把台湾纳入版图的时间非常晚。元朝在澎湖列岛设置"澎湖巡检司"是古代王朝最早设立官职管理台湾地区。只不过"澎湖巡检司"级别很低，比县令还要小一级，"澎湖巡检司"的管理范围只局限在澎湖，不包括台湾岛。
