次日，刘国轩攻击施琅的根据地八罩岛，不但没有成功，反而被施琅趁虚而入，夺取了澎湖外围的光井屿和桶盘屿。施琅对台澎地区了如指掌，总能打击到对方的兵力薄弱处，掌握了战场的主动权。
22日，施琅发动总攻，156条战船分三路夹攻澎湖主岛，他自己率中路主攻，左路负责吸引敌军注意力。刘国轩出动全部兵力进行抵抗，郑军船只的总数并不少，但船的坚固程度较差，火器也不及清军，在对战中很是吃亏。
战斗从早上打到中午，海面上刮起南风。清军正处在上风位置，帆船吃满风，速度加快，武器射程也增大不少。施琅乘此良机，把后备的80艘战船也加入战场，取得了数量优势，以五船围攻郑军一船。
经过一整天的激战，郑军水师彻底
