既然胡惟庸毒杀刘基都有待商榷，背后由朱元璋指使就更没有可能了。
那么，是谁提出这个猜想的呢？
《行状》说："先是杨宪败后汪广洋为丞相，未几而贬广东，乃相惟庸。公乃大戚，尝谓人曰:"使吾言不验，苍生之福也;言而验者，其如苍生何!"遂忧愤而旧疾愈增。洪武八年正月，胡丞相以医来视疾，饮其药二服，有物积腹中，如卷石。公遂白于上，上亦未之省也，自是疾遂笃。三月，上以公久不出，遣使问之，知其不能起也，特御制为文一通，遣使驰驿送公还乡里。居家一月而薨。"
吃了药后感觉不适，刘伯温向朱元璋提出怀疑，朱元璋是真的没有明白过来，还是揣着明白装糊涂？
上世纪七十年代台湾出版的刘基二十一世孙刘德隅编辑的《明刘伯温公生平事迹拾遗》也认为朱元璋是背后主谋。
