数量庞大的商船频繁航行于大洋之上，不仅使得白银大量流入中国（从1567年到1644年这段时间，海外流入明朝的白银总数约为3亿3千万两，相当于当时全世界生产的白银总量的三分之一），彻底扭转了明朝经济的颓势，促成了张居正一条鞭法的巨大成功。但与之相比，更为显著的负面影响却是：明朝这个集权帝国虽然长时间未有承认白银的法定货币地位，但却不得不接受银本位的事实；另外，原本朴实、忠君思想浓厚的中土人士在白花花的银子面前，思想发生了巨大变化。
因为当人性深处的贪欲一旦被巨大利益唤醒之后，就像打开了潘多拉魔盒一样，将会造成难以估量的后果。自明朝"大航海时代"开启之后，"从统治阶级到下层士大夫，贪欲心急剧膨胀"，社会奢靡成风，并且出于白银价值高以及保护私利的原因，社会大兴"窖藏"白银，明朝晚期艳情小说泛滥严重，这一系列与传统风气截然相反的现象便是明末"大航海时代"造就的私欲大膨胀的直接体现。
由此可见，"隆庆开关"之后的"大航海时代"虽然繁荣了明朝经济，但却让明帝国失去了两项至关重要的东西，一是法定货币的控制权，另一则是中国自古以来的国民精神，这也为明朝的灭亡埋下了两大祸根。
果然，当外部白银入口被堵死之后，明朝陡然陷入了钱荒局面，而私欲长期膨胀的民众和士大夫阶层在面对明朝国灭却表现得异常冷漠无情，宁可眼睁睁看着国家灭亡也绝不拿出"窖藏"白银，不得不说这也是明末"大航海时代"开启之后的必然产物，这进一步说明了明末"大航海时代"带来的3亿3千万两白银背后，是人性贪婪的大膨胀。
