卢象升本来能够彻底的击灭农民军，但就在这个时候清朝军队侵犯过来了。没有办法，卢象升只好带领军队回去救援。崇祯帝明面上命令卢象升去抵抗，私底下却准备议和。而且他名义上是总督，实际上手上的兵连2万都不到。而且边上的首辅和监军都在暗中拖他的后腿。导致最后卢象升被清朝的军队围困住，而监军手上有数万的关宁铁骑，却不去救援。而卢象升军队数量不多，又被围困住，最后被清军杀害。卢象升死了以后，首辅他们为了逃脱责任，对朝廷方面隐瞒了卢象升的死讯。足足过了80天卢象升的尸体才被收敛，而卢象升的弟弟上书请求旌表。却被首辅他们拒绝，直到最后首辅他们也战败自尽，忠臣卢象升才得以正名。
孙传庭，进士出身，擅长于战事。崇祯9年，他主动请求去闯王的老家陕西平乱。而义军的首领高迎祥，想从子午谷奇袭西安。而孙传庭猜到了他的想法，在谷口埋伏。最后大败农民军，活捉了高迎祥。崇祯11年，他在潼关设埋伏。将李自成的部下几乎杀完，闯王本人带着少数的骑兵逃走。这样关键的时候，如果不是清军再次来犯，李自成也难以活命。
卢象升阵亡以后，杨嗣昌希望将孙传庭麾下的军队留下来，用来防御清朝军队。孙传庭反对几次没有效果后，非常的无奈，只好告病还乡。而杨嗣昌依旧不打算放过他，向皇帝说孙传庭装病。崇祯非常的生气，将他关入大牢，这一关就是三年。
