左宗棠却有完全不同的看法，左宗棠认为，李鸿章张之洞的建议后患无穷，他曾经对幕僚表示，李鸿章张之洞都''糊涂''。大学士、钦差大臣、督办福建军务左宗棠在清廷下旨后不久，就上奏表示希望设立统一的海军机构，统一海军指挥权。
左宗棠对海军中央机构的首脑、职责都作了详尽的说明。他建议海军统一指挥机关成立后，下辖十大军。他说:''设海军十大军，每军铁甲、快船、鱼雷等皆备，设统领一员，帮统一员。以八军分驻各省海口，其余两军一巡东洋，一巡西洋，每年轮换''。左宗棠认为，现在设立三洋海军但是不设总指挥，将来必然互相掣肘，各方勾心斗角，一旦战事大开恐怕就会各自为战，所以他建立先设立海军部再设立三洋海军，只可惜他的见解没有得到支持就已经破产，最终甲午战争也印证了他的判断。
