随着士族力量的恢复和时势所限，第一个措施难以施行，因此，皇子镇地方政策就被南朝皇帝们奉为对抗士族政治的良策了。
然而，这项被奉为圭臬的政策，很快就为南朝带来了新的问题：皇族内讧。
一旦中央有变，有了地方实权的皇子们便逆向夺权，成为新的合法皇帝，比如宋孝武帝刘骏、梁元帝萧绎。
这还不算，为了防止其他皇族效仿，新上位的皇帝往往对其他皇族成员有所忌惮，而展开皇族大屠杀。前文提到的变态皇帝刘骏、刘子业、刘彧、萧鸾都是著名的皇族杀手，而刘宋和萧齐的皇族几乎被他们屠杀殆尽。而到了萧梁，萧衍的皇子们甚至置叛乱于不顾，等待着老皇帝咽气，然后入主中央。
