至于当时的西域东部，还有蒙古势力留下的两个地方政权--吐鲁番与哈密。他们都加入了明朝的朝贡国体系，不可能成为军事威胁。相反，他们会积极的保持商路畅通，确保有商队经过，拉动国内经济。这样明朝就更没有动力去出兵西域了。
最后，明朝军队自身的战斗力迅速退化，也是他们无力进军西域的原因。朱元璋时期订立的内敛化政策，也让明朝皇帝都不希望在自己的境内突然出现大批的异族人口。所以，只要能保持河西走廊的通道，控制住哈密与吐鲁番两个小国就足矣。
但在16世纪开始，新的叶尔羌汗国崛起，控制了几乎整个西域。而对明朝最为臣服的哈密，则已经在之前被稍强一些的吐鲁番吞并。明朝曾经在15世纪后期，多次救援哈密人。但最后还是发现自己无法控制局面，就只能不了了之。
此后，东北方向的军事压力上升，明朝就更加对西北事物没有兴趣了。
