宋太宗得知后，命令御史逮捕元佐，送到中书省审问，定案后将元佐废为平民，"安置"均州（治今湖北丹江口）。"安置"，是宋朝处罚遭贬皇亲、官员的专用词，实际意义是由当地官员监视居住，没有朝廷的诏旨不能离境。元佐接诏，离京而去。
元佐被贬，宰相宋琪率领百官三次上表，请求将元佐留在京师。宋太宗几经考虑，同意了百官的请求，召元佐回京，其时元佐已经走到黄山。
元佐回京，当然不能再住东宫，而是"废居"南宫，宋太宗还派人"守护"南宫，监视元佐。元佐在东宫时的属官"咨议"赵齐、王遹、"翊善"戴元请求宋太宗处罚自己未能很好地辅导元佐的失职之罪，宋太宗说："这个儿子我教他他都不改，你们怎么辅导？"
元佐失了父亲的心，也失去了当太子的机会。
