1999年考古队在明孝陵金水桥东侧开挖时，发现了砖井，井周围发现了砖结构和石遗迹，巨大柱基础露出地表。 已经决定的孝陵的其他砖块和石头进行比较，研究人员确认了这个遗迹和孝陵是同期的建筑物。 因为这个遗迹是当时发现的神宫附近唯一的建筑物，文化遗产相关人员推测这个建筑物很可能是神宫监狱的所在地。
既然帝国守护者的位置已经确定，地下弓玄也应该在附近。于是考古队立即召集地震工程研究所的工作人员，采用无损精密磁测技术，配合地面调查研究，终于揭开了一个隐藏了600多年的谜团--一--找到了明陵地下弓玄的位置，并确认朱元璋被埋在独龙府下数十米处，地下宫殿保存完好，排除了过去地下宫殿被盗的神话。
