光绪十六年（1890年）十一月，醇亲王奕譞突发疾病，光绪帝亲自前往探视，在光绪皇帝的老师翁同龢的日记中，对这对父子的最后一次见面，有着较为详细的记载。
根据《翁同龢日记》的记载，醇亲王奕譞与光绪帝谈话结束之后，奕譞解下带在身上的一块如意交与光绪帝，并嘱咐"无忘海军"，这块如意就是当年醇亲王巡阅北洋海防后慈禧所赐。由此可见，即使到了临终之际，醇亲王对于海军的建设仍然极为重视和不放心。
不久之后，醇亲王病逝，享年五十一岁，慈禧太后和光绪帝亲自前往祭奠。而北洋水师各舰得知消息后，同样以西式海军礼节降半旗10日，以此表达对这位大力支持海军建设的亲王的哀悼之情。
