万历四年(1576年)，巡按辽东御史刘台上疏称："自内阁首辅张居正专权以来，每次都说自己'吾是真正的相天下，什么事不可做?什么人不可擢退?'大小文武官员，非畏其威，则怀其德。张居正就是真正的具有宰相之实权也。"
在当时的文武百官看来，张居正已经傲然以当朝宰相自居，把六部科院看作是自己的属官，把群臣百官看作为自己的奴仆。
不论是台谏言官史孟麟批判张居正"阁臣侵六部科院之权"，、还是杨四知指责张居正"箝制言官"，都是因为在当时人的认识中，内阁首辅并非是真正的丞相，原本就没有统领部院行政机构和科道监察机构的权力。
