以此类推，而得出了《后汉书·孔融列传》中的结论:"孔融，字文举，鲁国人，孔子二十世孙。"但虽然孔融据史料记载，为孔子的第二十世孙，但这里也并不意味着，孔融是孔子的嫡系子孙。这里就牵扯了到古代的嫡庶问题。在礼法森严的古代嫡庶差别无疑十分巨大，而有资格继承爵位的，也唯有嫡系。虽然庶出的子孙同样可称为孔子后代，但其中亲疏，不言而明。
上文提到了，孔融并非孔子嫡系子孙。其实这从曹操对其痛下杀手的态度，就已经不难看出。若孔融为孔子嫡系二十世孙，为了表面的和平，不得罪根系错综复杂的孔氏家族，曹操也绝对会忍下的。但可惜事实并非如此，孔融虽然是孔子后代，但其血脉经过岁月冲刷，早已经不再亲厚，自然曹操也不会对其过于容忍。
而孔融因反对曹操挟天子以令诸侯的行径，再加之其处处掣肘曹操，要求增强汉室实权，惹得曹操对其嫌恶不已，最终于建安十三年（公元208年），孔融被曹操冠以"招合徒众，欲图不轨"、"谤讪朝廷，不遵朝仪"等罪名杀之，并株连三族。但也仅仅是三族而已，这对于已经根系颇丰的孔氏来说，并不会伤筋动骨，也不会影响到"衍圣公"的传承。这便是曹操杀了孔融三族，但"衍圣公"依旧传承的原因。
