而到了汉元帝时期，元帝封孔子的第十三世孙为褒成侯，其所得俸禄食邑，专门用以孔子的祭祀事宜。随后，孔子的后代便开始了世袭爵位的过程。汉平帝封孔子的十六世孙为褒成侯，并将爵位由关内侯提升为彻侯（有封国），食邑2000户。而到了王莽新汉时期，由于孔子后代不承认朝廷的正统性质，拒绝接受王莽授予的官职，因此失去爵位。直至东汉光武帝刘秀时期，才重新恢复爵位。
而到了北周静帝时期，孔子又被封邹国公，孔子后代也袭得此爵。隋朝又封孔子后裔为绍圣侯，至唐代，唐玄宗封孔子为文宣王，又封孔子第三十五世孙为文宣公。唐末失爵，直至五代十国时期，后唐又恢复了孔子后裔的爵位，并将文宣公之爵位沿用至北宋时期。北宋仁宗年间，仁宗赵祯认为孔子后人世袭孔子谥号为大不敬，便改封孔子后人为"衍圣公"。这便是"衍圣公"的由来。
而我们若是简单的分析一下孔子的家谱，也不难清楚孔融与孔子直系后代的关系。孔子唯有一子，名孔鲤。孔鲤也唯有一子，名孔伋。而就目前来看，几乎所有正统的孔氏后代，都是孔伋的后裔。而孔融自然也不例外。但从亲子孔鲤至七世孙孔谦，皆为单传。而到七世孙孔谦时，其有三子，分别是孔鮒、孔树、孔腾，而九世孙孔忠则为孔腾之子。
