这种畸形的军事力量配置，严重破坏了长城防线的平衡。所以明朝在长城西线面对周边各政权的袭扰时，就表现得十分无力。明朝在嘉峪关以西曾设安定、阿端、曲先、罕东、沙州、赤斤蒙古、哈密等七个卫，统称"关西七卫"。16世纪，吐鲁番汗国发动对哈密的战争，哈密对明朝求救，明朝却不发一兵一卒。最后哈密连带其他六个卫全部被吐鲁番吞并，吐鲁番军队一直打到肃州、甘州。而北面的河套地区在明英宗时期放弃之后，遂被蒙古鞑靼特部占据，并不断南下侵袭山陕一带，明朝除了骂他们是"套虏"之外，同样毫无办法。
"关西七卫"
嘉靖年间内阁首辅夏言曾建议收复河套地区，改善长城西线防御，结果被嘉靖帝斩首，从此没人再敢提收复河套的事了。至于广大的南方地区，那防御力量就更是战五渣了。嘉靖年间七十二个倭寇肆虐江南数十个州县，杀伤明朝军民数千人，甚至一直打到南京城下，南方明军的力量之薄弱可见一斑。
