在万历二十二年以后，根据王嘉谟的建议，登闻鼓又添加一条新的规定，那就是每次登闻鼓案件都要先由刑部、大理寺、都察院三法司一起审理，看看是否的确是冤假错案，决定是否要受理此案，再转交给皇帝，"此后民奏诉，请下法司详鞠，果系枉抑，方与行勘，诏可之。"
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登闻鼓案件的受理时间和一般的案件相比也有极大的区别，普通案件何时受理，明代并没有明确规定，随时可以击鼓鸣冤，乃至于死刑犯执行死刑的当天，罪犯亲属都可以击鼓鸣冤。
比如成化年间就有"戮死罪囚三十三人于市。……将行刑，有十九人母妻讼冤登闻鼓下，给事中以闻，诏留重鞠之"。
