这个制度真正的问题是，举荐人在举荐人才时容易掺入个人感情，并且，随着士族门阀对政治话语权的全方位垄断，在人才的选举过程中，着重门第的情况越来越严重。
到了魏晋易代之际，这种蜕变彻底成为正式的制度：曹魏末年，司马懿之孙司马炎在士族门阀的拥戴下篡夺了曹魏的江山，建立西晋。当时，朝堂之上遍布这些门阀的后代，他们既出身世家大族，又累世为官，为保证自身权利可以世代相传，便将九品中正制中衡量个人才能的原则改成了计算门第与资历。早在曹魏时期，九品中正制就已经有看重门第的倾向，这次更是将这种倾向以制度化的形式确立。
司马炎
由于新制带来的利益基本全部倒向了世家大族，故此举一出，各种抨击纷至沓来。但这些批评都是士族门阀内部的争执：一些不那么显赫的士族认为这项改革使得高门大族占尽优势，若长此以往，自己将永无出头之日。事实上，西晋之后的九品中正制不但没有改善原本存在的弊病，反而不断加深了问题的严重性，造成"上品无寒门，下品无势族"的局面，严重阻碍了正常的社会阶层流动。
