冯白驹突围之后，重新组建红军游击小组，开展武装斗争，到1936年5月，海南岛基本上建立各县委领导机构，接着建立红军游击司令部，使琼崖革命星火普遍燎原起来了。
全面抗战爆发后，海南岛也遭到了日军的侵略。1939年2月10日，日军一个混成旅团在日本海军舰队的掩护下，向海南岛发动进攻。此时海南岛的国民党军守军兵力很弱，只有一个旅，下辖两个保安团，一个独立大队，还有新编的守备部队7个营，共3900余人。
在日军的攻击下，国民党军节节败退，被日军杀害的无辜群众高达数万人。为了共同抵御日寇的侵略，岛上的国民党军和冯白驹领导的部队联合起来，冯白驹领导的部队改编为一个独立大队，下辖三个中队，冯白驹任大队长。1938年独立大队刚成立的时候，总兵力只有300余人。
在冯白驹的领导下，海南岛的群众很快被发展了起来，截止到1939年3月，独立大队扩编为独立总队，下辖三个大队和一个特务中队，总兵力由原来的300多人发展到了1000余人，武器装备也得到了一定程度的改善。1939年3月7日，独立总队第一大队的两个中队在美兰和三江之间的罗牛桥伏击日军，击毙日军一名大佐和士兵20余人，击毁军车两辆。到1939年2月，冯白驹领导的部队和日军作战70余次，击毙日军500余人，缴获机枪2挺，迫击炮一门，枪械数十支和一大批军需物资。
