眼看实施近一年的"河防计划"即将竣工，居然让赖文光、任化邦等轻松突破防线，曾国藩垂头丧气，清廷亦是大为不满。为此，曾国藩去职，改由李鸿章督率三军，继续围剿"捻军"。李鸿章上任后，继续执行曾国藩"河防计划"之同时极力发展骑兵部队（刘铭传、潘定新统领），试图追击"捻军"，在野战中将其扑灭。1867年1月，赖文光、任化邦在湖北钟祥设伏，击毙淮军4000余人，悍将郭松林差点毙命。不久，张树珊所部淮军再次遭到埋伏，阵亡千余人，张树珊被斩杀。2月，赖文光、任化邦再次设伏尹隆河，引诱刘铭传部追击。此战，刘铭传奋勇拼杀，可因贪功冒进，未等鲍超部"霆军"便先一步行动，身陷重围。赖文光也乘此机会出动主力围攻刘铭传，将他团团包围。此时，刘铭传见大势已去，直接脱下官服，即将束手就擒。可惜，悍将鲍超率"霆军"8000余人突然从背后杀出，迫使赖文光分兵拒敌，淮军转败为胜，刘铭传躲过一劫。
尹隆河之战后，赖文光、任化邦率"捻军"转战山东，并冲破胶莱河防线，进运河以东地区，声势一度复起。然而，连年转战，又没有固定基地，"捻军"注定成不了气候，赖文光直言："独立难持，孤立难久"。1867年11月，赖文光在江苏潍县被刘铭传连败三次，部队损失惨重。1868年1月，刘铭传追击"捻军"到扬州瓦窑堡，赖文光奋起反击，再次爆发大战。可惜，敌众我寡，赖文光战败受伤，被俘虏。被俘虏后，清军劝他投降，识时务者为俊杰，可赖文光拒绝，直言："惟一死以报国家，以全臣节"，想做文天祥第二，被凌迟而死。
