清朝从顺治帝开始，便多次颁布禁海令，在沿海地区实行海禁，并将沿海居民迁往内地，史称"迁界"。当时海禁主要出于两个方面的考虑：一来沿海多贼寇，出于百姓安全考虑；二来是为了对付占据东南沿海的南明势力，孤立据守台湾的郑成功。
第二阶段，是从康熙二十三年（1684年）到乾隆二十二年（1757年）。
康熙二十二年，台湾纳入了清朝的版图，次年的七月，康熙便下令开放海禁了，设海关，定关税，海上贸易一片繁荣的景象。不过期间曾有过短暂的南洋贸易之禁，主要是在康熙五十六年，由于"愚民私聚吕宋、噶喇吧而盗米透漏"，害怕本国商人出南洋勾结海盗，所以这才又实行海禁的。
不过禁令虽不准本国商人出海，但还是允许外商来华的。一直到了雍正五年，禁令才重新被解除。这段时间内，清廷的国门是较为开放的。
