那，奴儿干都司是干嘛的呢？是类似内地"省会"一样管理广大地域的吗？这想想就知道不可能，东北地区极为辽阔，一个小小的奴儿干城根本不可能起到统辖全地域的效果，这些部族互相联络都很困难，更别提集中起来了。
根据记载，奴儿干都司最盛（万历年间）时有384个卫，24个所、7个地面、7个站、1个寨，通常直接简称384卫，但这些卫所和明朝中央都是直接联系的，并不需要再通过奴儿干都司这一环节。
既然管理职能不具备，那奴儿干都司的实际职责是干嘛的呢？
答案是招抚！
东北这么一大片地方因为没有直接控制，所以需要通过"招抚"不停维持存在感的，在设立了奴儿干都司后，朱棣派遣心腹太监亦失哈前去黑龙江地区进一步开拓，以加大明廷的影响力。从永乐九年（1411年）至宣德八年（1433年）的二十二年里，亦失哈多次奉旨巡视黑龙江流域（俗称"九巡北海"），亦失哈曾经主持在奴儿干城修建永宁寺供奉观世音菩萨，并用汉文、蒙古文和女真文竖立石碑以记其事，这是唯一一块在女真人建立的金朝灭亡之后刻有女真文的石碑，宣德七年（1432年）亦失哈再度巡视此处发现庙已毁，便下令重修永宁寺，同时另立一块石碑--《重建永宁寺记》，宣德碑全为汉文。1904年，两座石碑被搬移进符拉迪沃斯托克（海参崴）的两座博物馆。
