虽然青海罗卜藏丹津叛乱被迅速平定，但准噶尔的战况就相当不顺利了，先头部队直接全军覆没，后来的战斗互有胜负，清军也未能取得战略优势，只能同准噶尔议和，双方以阿尔泰山为界。
一直到了乾隆十年（1745），准噶尔地区爆发了大规模瘟疫，可汗病死两个儿子为了争位互掐起来，致使准噶尔汗国陷入了内乱。哥哥刚把弟弟杀死，屁股还没来得及做热，就被达瓦齐与阿睦尔撒纳联手杀掉了，达瓦齐成为准噶尔汗国的浑台吉（首领）。同患难易，共富贵难，很快这两个人就因为相互猜忌而发生了火拼。
阿睦尔撒纳被打得鼻青脸肿，转头就投靠了清朝，把准噶尔汗国的虚实全部透露给了乾隆皇帝。根据这一情报，清军迅速出击，一路上准噶尔"大者数千户，小者数百户，携酮酪，献羊马、络绎道左，行数千里，无一人抗颜者"，直接灭亡了准噶尔汗国。爷爷、老子都没做到的时期，被孙子用几个月的时间就做到了，顺利得不可思议。
