太平天国不同于传统的改朝换代，而是妄图彻底摧毁封建统治根基--儒家学说，这就很有问题了，事实上中国传统的封建王朝虽然看起来是皇帝当家，大臣治理；但国家和社会实则是掌握在以乡绅地主为核心的地主阶级手中，而封建道德和文化则是以以士大夫阶层为核心的知识分子所控制，传统的改朝换代并不会变动这两个阶层，只不过是台面上的皇帝和大臣变了而已，也就是说仅仅是统治阶级换个代言人。曾国藩就写道：李自成至曲阜不犯圣庙，张献忠至梓潼亦祭文昌。
而太平天国完全不同，它的思想是从西方传过来的异教，对于地主阶级和知识分子来说，这就很危险了，因为太平天国的成功意味着他们将一无所有，所以太平天国运动除了一些底层贫民之外，在社会的中上阶层往往找不到任何合作者，因为它们的主张和乡绅地主以及知识分子是完全对立的，曾国藩写道"举中国数千年礼义人伦诗书典则，一旦扫地荡尽。此岂独我大清之变，乃开辟以来名教之奇变，我孔子、孟子之所痛哭于九原"。
而这，才是太平天国失败的根本原因，那么，难道封建制度就没办法被推翻吗？当然不是，但是想推翻封建制度，必须要有一个更强大的阶层进行革命，太平天国的小农集团是达不成目的的，所以其失败是必然的。
