勤王军进逼杭州，苗刘大为惊恐，被迫率百官奏请赵构复辟。赵构还宫后，故意任命苗傅为淮西制置使，刘正彦为淮西制置副使，将他们引出朝廷，隔天下诏恢复年号建炎。苗、刘二人担心人头不保，要求高宗赐免死铁券。这一次，二人吃了没文化的亏，高宗痛快赐了免死铁券，但上面写的是"除大逆外，余皆不论"。
在韩世忠的进攻下，苗傅和刘正彦率两千人逃出杭州。韩世忠追歼残部, 苗傅和刘正彦被俘后, 被处以磔刑。
勤王军赶至行宫, 宋高宗步出宫门, 执韩世忠之手, 恸哭一番。历时一月的政变宣告结束。高宗下诏封赏平乱功臣。短短几个月内，淮扬之难、苗刘兵变接连发生,宋高宗的心理大受打击。随后他下了罪己诏,表示愿"深自修省, 悔过责躬。"，并制订了一些必要的制度和措施，在军事上也做了相应的防御准备，人心因此稍稳。
因为一场兵变而空前团结的将领，虽然解救了宋高宗，但也成了他的心头刺。重文抑武本就是宋朝的基本国策，这场兵变让宋高宗对武将的恐惧更重，他再不敢信任武将，于是把兵权牢牢掌握在自己手中。
宋高宗唯一的子嗣太子赵旉自幼体弱多病，一路颠簸南逃，再加上兵变中受到的惊吓，很快就一命呜呼。而此时宋高宗已无生育能力。未来赵家江山该怎样存续？再想到当初苗傅在城下对自己的质问：若钦宗归来，将如何自处？宋高宗便更无一点北伐的心思。
一场因兵变带来的高效"团建"原本可以凝聚人心、一致对外，却在高宗的忌惮下最终土崩瓦解。
