这些都准备得差不多了之后，孝宗皇帝又嚷嚷着北伐，虞允文又说这不是一蹴而就的事情，因为双方的实力比较均衡，因此要做好打持久战的准备，所以还得重视农业生产，保证战时的后勤供应。于是孝宗就按照他的建议，实行了兴修水利，轻徭薄赋等政策。
又过了几年，孝宗皇帝干脆升虞允文为左相，把北伐的事宜全都托付给他。同时为了达到政治平衡，孝宗又任命了主和派的梁克家为右相兼枢密使，导致虞允文做事处处掣肘。时间一长，俩人就发生了矛盾，孝宗皇帝见状，只好让他回到四川继续准备北伐大业。
虞允文临走之前，孝宗拉着他的手动情地说道："若西路出而朕迟回，即朕负卿；若朕已动而卿迟回，则卿负朕。"虞允文深受感动，郑重地点了点头。
他回到四川之后，发展生产、训练士卒、筹备军粮，积极落实北伐准备。孝宗皇帝心急，不到一年就来催问发兵日期。
