《讨粤匪檄》并不是曾国藩主动出击的作品，它是曾国藩等人的反击之作，但是这篇檄文一出手，曾国藩与洪秀全等人的水平高低就一目了然。洪秀全等人在取得了初步的胜利之后，便开始试图在舆论上压倒清政府，以获取底层民众的支持。以杨秀清和萧朝贵等人为首的太平军，先后发布了三篇檄文来声讨清政府：《奉天讨胡檄布四方谕》《奉天诛妖救世安民谕》和《救一切天生天养中国人民谕》，而《讨粤匪檄》是针对这些檄文的逐条批驳之作，曾国藩的毕生的学识和思想在这篇檄文中体现得淋漓尽致。
太平天国的檄文首先就从清朝的祖坟开始挖起，动摇满清政权的合法性："非胡虏之天下也"，而后具体地指出了清朝的"罪状"，如易变形像、毁弃衣冠、变乱种族、玷辱女性、破坏制度、新造语言、不赈灾民等等，尤其是对于官吏腐败和歧视汉族的极力描绘，体现了太平天国内部的核心思想。杨秀清和萧朝贵等人力图以"夷夏之辨"这一传统武器，来唤醒民众的历史记忆和种族意识，从而达到他们占领舆论制高点的目的。这不由得令人想起了当年陈琳骂曹操的檄文，走的也是挖人祖坟的路子，曹操看完之后被气得头痛病都好了。
但是杨秀清等人的学识毕竟不高，他们的檄文虽然在前期起到了一定作用，但实际上埋下了相当大的隐患。"天下者，上帝之天下"，可谓是太平天国一直以来的口号，拜上帝教确实起到了一定的笼络人心的作用，然而宗教并不能支撑起太平天国存在的底层逻辑。更为重要的是，太平天国极度尊崇"天父"而极力贬斥"礼教"，为此失去了士大夫以及一般读书人的支持。洪秀全等人虽然能够在檄文中控诉儒家甚至在现实中砸烂孔子的牌位，但他们的学识不足以支持他们建立新的理论体系，儒家的地位依旧占领了当时大多数人的制高点。
