"文武之道一张一弛"正为东林党渐成尾大不掉之势而心焦的天启帝。索性借乘着杨莲等人要求诛杀的魏忠贤的大风，反其道而行之，一举提拔魏忠贤为司礼监秉笔太监，统领内廷庶务，辅佐皇帝处理机要。拔擢了魏忠贤的天启帝趁势退居幕后、深藏禁宫，从而避开与东林党的正面交锋。一方面钻研喜爱的木匠工艺，另一方面则操纵棋子，遥控时局。当时朝廷里面阉党和东林党正闹得势同水火，于是朱由校不但不想着灭火，反而是火上浇油。他开始通过一些装傻充愣的方式赋予了以魏忠贤为首的阉党权利，让他们去对抗东林党人。朱由校的这个策略玩的很像他爷爷万历，通过各种手段来平衡朝中势力，自己在后面做推手操控朝政。
朱由校在位期间，任由阉党对东林党进行打压，期间更是制造"东林六君子"的惨案。是否是朱由校洞察到了什么，想通过阉党来重新获得国之根本--税收的话语权。结果确实有成效，天启年间每年都能从浙江一地收到20万两的茶税，是前面历任皇帝的数倍。天启元年，明朝先后丢掉辽阳，广宁等军事重地，后金对大明的威胁进一步加强。天启任用了孙承宗，袁可立，袁崇焕等真正一批有能力的人，才将辽东局势一度稳定下来。可惜这些人后来卷入党争，成为了政治牺牲品。但不得不说，朱由校对于人才任用还是有独到之处的。可惜的就是还没有把控住朝政，党派间的斗争让他很难坚定不移的使用一个人。
