结果到了英国殖民文化盛行时期，受英式教育的影响，峇峇开始认为英国才是自己的宗主国，所以他们在族群特性和民族意识混乱的情况下，选择皈依基督教，这种信仰的转变让马来人难以接受，所以两个民族间的矛盾隔阂越变越大。
到了马来半岛独立时期，马来人又通过推行各种抵制政策，去改变峇峇娘惹族群的生活习惯及政治经济活动。因为深知政权都掌握在马来人手里，他们又将自己的政治效忠对象转为当时的马来半岛政府。
而从小接受华文教育的纯种华人，认为峇峇娘惹数典忘祖，不仅将母体文化发展成了"四不像"，还在国家认同这个严肃问题上摇摆不定，最终迷失自己。
