后来拓跋弘生了儿子，文明皇后十分开心，就将朝中的大权还给了拓跋弘。而拓跋弘拿到大权之后，是想要挣脱母后的管束，想要一个人控制朝廷，所以就任用，甚至是重用了不被文明皇后重视的大臣们。后来拓跋弘知道母后有很多的宠成，觉得自己很丢脸，所以就下令将其中为首的李奕给处死了。文明皇后十分生气，母子关系也闹得很僵，甚至是决裂。后来文明皇后还联合了诸位大臣，一起将拓跋弘逼的退位，亲手将儿子秘密杀害。
在拓跋弘死后，文明皇后就让其长孙，也就是拓跋弘的儿子拓跋宏继位。而长孙拓跋宏只有5岁，所以文明皇后再度把持朝政。虽然她杀了自己的儿子，但是对这个孙子还是很疼惜的，并且一直都是有意识地培养其政治才能。
在文明皇后主持朝政的这么多年里，她一直都是大力号召改革，要求北魏人学习汉人，开启了鲜卑族汉化的进程。
后来在文明皇后去世之前，她亲手将大权还给了北魏孝文帝，而且要求自己的葬礼一定是从简进行的。在她执政的这20多年时间里，北魏发生了巨大的变化，国家安定，百姓富足，最重要的是，还培养了明君孝文帝。所以文明皇后，就是当之无愧的千古一后
