邓遐敢到汉水中斩杀蛟龙，这勇力也太大了，军中没有人不怕他。海西公司马奕太和四年（369），桓温北伐大败于枋头。桓温感到羞愧和怨恨，因为邓遐太勇猛，他怕邓遐将来会作乱，就免了邓遐的官。时间不长，邓遐就病死了。孝武帝司马曜宁康年间（373-375），邓遐被追赠为庐陵太守。
邓遐死后，乡人仍对他念念不忘，感谢他斩蛟除害之因。因为他曾任二郎将，便立二郎庙供之，将其奉为二郎神。《古今图书集成职方典》卷九四七："二郎神庙，在（杭州）府城忠清里。神姓邓，讳遐，挥剑截蛟，数断而出，自是患息。乡人德之，为立祠祀之，以其尝为二郎将，故尊为二郎神。"此后，邓遐与四川灌口二郎等并为神话中的"二郎神"原型。
