有人认为李秀成的原稿被曾国藩的后人所收藏，也有人说被焚毁了，不过目前曾国藩的后人在1963年中公示的那份李秀成供罪书里面也只有33000多字。而在这33000多字的原稿中有很多的修改痕迹，最终交给朝廷的肯定是修改后的版本。
从目前所存在的原稿文件中，我们可以十分直观的看出来有很多修改的痕迹，而且这修改后的版本显然是更能彰显出曾国藩自己的功劳。
--比如李秀成交代自己被俘的原因是因为"心有私忌，两家并争，因此我而藏不住，是以被两个奸民获拿，解送前来。"这段话交代出李秀成是被两个老百姓在山洞之中发现，抓获之后为了邀功领赏而交给曾国藩军队的。
而曾国藩在抓获李秀成之后给朝廷写了一个奏折，奏折中所写的内容为"忠王一犯，城破受伤，匿于山内民房，十九夜萧孚泗亲自搜出。"
奏折中所讲则是说官兵奋力破城之后，李秀成受伤藏在了民房家中，然后被一个叫做萧孚泗亲自搜寻并且抓获了，奏折和李秀成的供词有着明显的出入。在曾国藩的奏折里是为了彰显这个叫做萧孚泗的功劳，但李秀成的供词却否定了这一点。
