为了获取生活必须品，他们不得不打通中亚的贸易市场，他们与哈萨克人的冲突因此而起。因为有察哈台汗国的帮助，又加之后来瓦剌内讧不断，哈萨克人不仅成功了降服了瓦剌的土尔扈特、杜尔伯特等部，而且还迫使他们转而向青海寻找新牧场。
17世纪时，瓦剌的准噶尔部出了位牛人叫巴图尔珲台吉。他积极团结瓦剌各部，结束了东、西蒙古将近一个世纪的纷争，还与喀尔喀的札萨克图汗一同制定了《喀尔喀-卫拉特法典》，增强了蒙古各部之间的团结和对外协同作战的能力。
在相对稳定的环境下，准噶尔部迅速崛起，巴图尔珲台吉开始向哈萨克发动积极的进攻。双方大战多场，虽然以哈萨克"在所有的事情上都仰望巴图尔珲台吉，并服从他"为终，但准噶尔占据的优势并不明显。
