而在魏国这边，本来是文臣的司马懿，靠着与诸葛亮的对抗，成功掌握了军权。在诸葛亮北伐失败以后，魏帝马上命令腾出手来的司马懿去辽东对付公孙渊。在公元238年，司马懿带着4万人前来攻打公孙渊，公孙渊大败被斩杀。
城破之后，司马懿为了斩草除根，竟将城内15岁以上的男子总共7000多人尽数杀死，公孙渊任命的官员被杀者也多达2000余人。辽东百姓本来也就小几十万人，此战之后被司马懿悉数迁到了中原地区。原本强盛了近50年的燕国就此衰落。
由于公孙氏的覆灭，辽东出现了势力真空。而此前被打得七零八落的高句丽乘机崛起。原来公孙渊虽不强，但还能够控制高句丽，现在好战的高句丽更加肆无忌惮，他们一直攻打了魏国边境。后来西晋建立，但不到50年后即将覆亡，中原再次大乱。
