马新贻死后，如何处置凶手张文祥成为了头等大事。马新贻是位高权重的两江总督，在清王朝的几个封疆大吏中也是排得上号的人物。江南一带的官员知道此事事关重大，于是，都不敢擅作主张。他们将这个案件报给了朝廷，想要让同治皇帝和慈禧太后决断。
同治帝接到奏疏后仔仔细细看了好几遍，然后，吃惊地说道：“朕实在是想不到，这个狂贼竟然胆敢谋杀朝廷重臣，而且还是当众行凶。朕观前朝的历史，类似的事情几乎没有发生，只有唐朝有个名叫武元衡的宰相被人杀害过。不过，这距离现在已经有一千多年了。”
为了维护皇家的尊严，同治帝令驻守南京的大将魁玉等人对张文祥严加审讯，务必要找到背后的主使者。魁玉接到命令后，赶忙和几位高官一起提审了张文祥。张文祥自知命不久矣，于是，丝毫不纠缠，直接说出了自己杀害马总督的原因。
据张文祥招认，他是马总督治下的百姓。之前，因为妻子被人霸占，他曾经多次找马总督伸冤，想让马总督为自己主持公道。但是，马总督总是在张文祥面前摆出一副高高在上的样子，根本不把张文祥的案子当一回事。他苦苦哀求，好话说尽，但马总督还是不为所动。
所以，无奈之下，张文祥只好请黑道上的朋友出面摆平此事。但是，在马总督的镇压下，张文祥的这些朋友不是被抓就是被杀，残存的几个也都再不敢露头。张文祥越想越生气，就将一腔怒火都发泄到了马总督的身上。
要说这两个原因只是让张文祥愤怒的话，那么，马总督近期的一项举措就直接将张文祥逼上了绝路，这个举措就是：禁止高利贷相关行业的存在。
平心而论，马新贻这样做，完全是为了百姓着想。毕竟，因为高利贷而引发的家庭悲剧是数不胜数。但不偏不倚，张文祥的绝大部分收入都是来源于这类行业的。马总督的做法，直接让张文祥成为了无业游民。失去了生存的依仗，妻子也被抢走。
新仇旧恨加起来，张文祥忍无可忍，于是，就铤而走险，不惜以性命为代价犯下了杀人罪行。
魁玉等人将审讯结果呈递到朝廷之后，同治帝和慈禧太后都很不满意。出于个人私愤的原因竟然谋杀了朝廷的封疆大吏，而且，还越过了总督的层层护卫。无论如何，这样的说法都是很难服众的。慈禧太后对此案非常关注，她将魁玉等人的审讯结果搁在一旁，改让负责漕运的官员张之万和刑部尚书郑敦谨审查此案。
张之万接受此案后，马上便发现了一个疑点。原来，罪犯张文祥之前曾经被太平天国的人活捉。而他之所以能够活到现在，只是因为他趁太平军不备，偷偷地逃了出来。当时，与他一起逃脱的，还有一个名叫金彪的人。这个信息在魁玉审案的时候张文祥就已经吐露，但是，魁玉听后吓得面如死灰，坚决不肯将张文祥与太平天国的关系记录下来。
