1992年6月，盖达尔出任代总理，达到他政治生涯的最高峰。然而事与愿违，在南美大获成功的“休克疗法”，在俄罗斯却非常不成功。大量国有企业落入特权阶层手中，国有财产不断遭到吞噬，普通人却没有丝毫参与权。通货膨胀，物价飞涨，劳动生产率急剧低下，GDP总量只有美国的1/10，生活水平更是一落千丈……盖达尔面临空前激烈地舆论指责，在主持内阁半年后，叶利钦下令免掉了他的职务，由稳健派经济学家切尔诺梅尔金接任总理。
1993年9月，叶利钦与杜马斗争高峰时，盖达尔再次担任第一副总理。但4个月后他再次被迫离职，并彻底结束了自己政府任职生涯。下野之后，盖达尔成立了“俄罗斯转型经济研究所”，继续从事学术研究。2009年12月16日，盖达尔在莫斯科郊区家中因脑血栓病逝，享年53岁。他的助手说盖达尔死得非常意外，死前还正在写作一本给儿童的书。死讯传出，时任俄罗斯总理普京致哀道:“盖达尔的死是俄罗斯的重大损失”。
盖达尔去世后，在第一场杜马会议上，一位议员提议为他默哀一分钟，但遭到大部分议员的拒绝。在俄罗斯普通民众心目中，盖达尔也是个令人厌恶的角色，因为由他主导的改革让他们失去了几乎一切。不过也有一些政经学家认为，盖达尔其实是一位避免了巨大灾难的英雄，他们认为：“在俄罗斯历史上最糟糕的时候，能拥有盖达尔乃是一笔巨大的财富。在1990年代，他从饥荒、内战和分崩离析中拯救了国家。”
