回国后宁泽涛就被曝出被调离国家队的消息，在2017年2月，甚至还曝出了国家体育总局下发的红头文件，确认宁泽涛因私自代言广告，不服从国家队竞赛安排，拒绝参加接力项目资格赛等问题，被调回原单位。而且从文件下发日期来看，早在2016年10月份就已经有了此通知，也就是里约奥运会刚结束没多久。
有了体育总局下发的通知后，宁泽涛的口碑彻底崩盘，网友都怒斥他被金钱蒙蔽双眼，竟然从天之骄子变成了国家队里不服管教的"刺头"。
但是事件也伴随了很多争议，最终在一个月后，游泳中心的领导层再次进行人事调动，宁泽涛才又重新回到了国家队。这次回归也让宁泽涛内心憋了一股劲儿，势必要打一场翻身仗。在2017年迅速调整状态，一年之内就夺得了四次金牌：
7月16日，在昆士兰短池游泳赛100米自由泳比赛中，以46秒64成绩夺得冠军；
8月19日，在昆士兰短池游泳锦标赛男子100米自由泳项目中，以46秒14成绩摘金，并打破亚洲纪录。
9月4日，在第十三届全运会男子100米自由泳决赛中，以47.92秒夺冠。
9月6日，全运会游泳比赛男子50米自由泳决赛中，以22秒04获得冠军。
不过2017年的四次冠军也成了他最后的辉煌，之后的宁泽涛鲜少比赛，关注度也渐渐降低。一直到2019年年仅26岁的宁泽涛宣布退役，"亚洲飞鱼"的草草落幕不禁让人唏嘘。
退役后的宁泽涛先将个人社交帐号简介改成"资深游泳爱好者"，并且进入郑州大学继续完成学业。
还有消息传出他将要进军娱乐圈，但是都被他否认，表示自己性格并不适合进娱乐圈。
