但是，这样一个几乎完美无缺的皇后却有着一个致命的缺点：嫉妒心极强，甚至到了扭曲的程度。
有一次，隋文帝在宫中发现了一位非常漂亮的女子，一时冲动就宠幸了她。按说整个后宫里的女人都是皇帝的，宠幸一个宫女不算什么大事儿，但是独孤皇后却趁着隋文帝上朝的时候偷偷把那个女子杀了，隋文帝听说后非常愤怒，他只身骑马一路狂奔30里，直到大臣们追上才停下来。他无奈地说道"我身为天子，地位高贵，却没有自由"。
独孤皇后嫉妒心强到什么程度呢？不但不允许皇帝宠幸别的女人，连大臣们的小妾怀了孩子，她都会让皇帝严加斥责，连自己的儿子也不例外。
独孤皇后给太子杨勇挑选了一位太子妃元氏，希望他们恩恩爱爱，可是杨勇却一点都不喜欢这位元氏，反而非常宠爱一位小妾云氏，这可犯了皇后的大忌了。后来，元氏因病去世，独孤皇后就执意认为元氏是被狐狸精云氏害死的，对太子愈发不满。
